Continuação de Shadowverse Flame. A história se concentra em Hiiro Ryuugasaki, um estudante da Academia Tensei. Através de um estranho incidente, Hiiro obtém um smartphone misterioso. O smartphone tem o popular jogo de cartas digitais Shadowverse instalado. Através do jogo, Hiiro conhece rivais, participa de torneios e forma vínculos.